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(一)在职教工党支部(括号内为各支部简称)

中共浙江大学药学院药物信息学研究所教工支部(药信所教工支部)

中共浙江大学药学院药物研究所教工支部(药物所教工支部)

中共浙江大学药学院现代中药研究所教工支部(中药所教工支部)

中共浙江大学药学院药物制剂研究所教工支部(药剂所教工支部)

中共浙江大学药学院药理毒理与生化药学研究所教工支部(药理所教工支部)

中共浙江大学药学院药学实验中心教工支部(实验中心教工支部)

中共浙江大学药学院机关支部(机关支部)

(二)学生党支部

中共浙江大学药学院本科生支部(本科支部)

中共浙江大学药学院药物研究所研究生药化第一支部(药化研一支部)

中共浙江大学药学院药物研究所研究生药化第二支部(药化研二支部) 

中共浙江大学药学院药物研究所研究生第三支部(药分)(药分研支部)

中共浙江大学药学院药物制剂研究所研究生支部(药剂研支部)

中共浙江大学药学院药理毒理与生化药学研究所研究生第一支部(药理研一支部)

中共浙江大学药学院药理毒理与生化药学研究所研究生第二支部(药理研二支部) 

中共浙江大学药学院现代中药研究所研究生支部(中药研支部)

中共浙江大学药学院药物信息学研究所研究生支部(药信研支部)

(三)退休党支部

中共浙江大学药学院退休支部(退休支部)