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  • 姓  名:李丹
  • 职称职务:副教授、硕士生导师
  • 联系电话:0571-88208412
  • 电子邮箱:lidancps@zju.edu.cn
  • 办公地址:浙江大学紫金港校区药学院446室
个人简介

一、学习工作经历

1996年9月至2000年6月:中国药科大学,药学院,学士

2001年9月至2004年6月:中国药科大学,药学院药物化学系,硕士

2005年2月至2009年4月:德国马堡大学,药学院药物化学系,博士

2009年5月至2010年2月:德国马堡大学,药学院药物化学系,博士后

2010年7月至2013年5月:德国吉森大学,生物化学系,洪堡学者

2013年5月至2013年12月:浙江大学,药学院,教师

2013年12月至今:浙江大学,药学院,副教授

 

二、研究方向

创新型(新靶点、新结构、新的筛选思路和策略)小分子药物的设计和发现。针对相应靶点,通过分子对接、分子动力学模拟和自由能计算等计算机辅助药物设计方法发现潜在的候选活性化合物;对候选化合物进行酶、细胞或细菌活性评价,并且通过生化和分子生物学手段进行深入的分子水平的论证和研究。目前研究体系主要包括:(1). 以卡介苗菌株BCG为模式菌,设计和发现抗结核杆菌药物;(2).针对雄激素受体,设计和发现抗前列腺癌药物。

 

三、代表性论文

1.  Zhang Q, Feng T, Xu L, Sun HY, Pan PC, Li YY, Li D*, Hou TJ*, Recent advances on protein-protein docking, Current Drug Targets, 2016, 17, 1586-1594.

2.  Liu H, Li D, Li YY, Hou TJ*, Atomistic molecular dynamics simulations of ATP-binding cassette transporters, WIREs Computational Molecular Science, 2016, 6, 255-265. (封面论文)

3.  Guan Y, Sun HY, Pan PC, Li YY, Li D*,Hou TJ*, Exploring resistance mechanisms of HCV NS3/4A protease mutations to MK5172: insight from molecular dynamics simulations and free energy calculations,Molecular Biosystems,2015, 11, 2568-78.

4.  Li D, Chen L, Li YY, Tian S, Sun HY, Hou TJ*,ADMET evaluation in drug discovery. 13. development of in silico prediction models for P-Glycoprotein substrates. Molecular Pharmaceutics,2014, 11, 716-26. (扩展ESI高引论文)

5.  Pan PC, Li L, Li YY,Li D*, Hou TJ*,Insights into susceptibility of antiviral drugs against the E119G mutant of 2009 influenza A (H1N1) neuraminidase by molecular dynamics simulations and free energy calculations,Antiviral Research,2013, 100, 356-64.

6.  Preußer C, Rossbach O, Hung LH, Li D, Bindereif A*,Genome-wide RNA-binding analysis of the trypanosome U1 snRNP proteins U1C and U1-70K reveals cis/trans-spliceosomal network,Nucleic Acids Research, 2014, 42, 6603-15.

7.  Li D, Gössringer M, Hartmann RK*,Archaeal-bacterial chimeric RNase P RNAs: towards understanding RNA's architecture, function and evolution,Chembiochem, 2011, 12, 1536-43.

8.  Li D, Meyer MH, Willkomm DK, Keusgen M, Hartmann RK*,Analysis of bacterial RNase P RNA and protein interaction by a magnetic biosensor technique,Biochimie. 2010, 92, 772-8.

9.  Li D, Willkomm DK, Hartmann RK*,Minor changes largely restore catalytic activity of archaeal RNase P RNA from Methanothermobacter thermoautotrophicus,Nucleic Acids Research, 2009,37, 231-42.

10.  Li D, Willkomm DK, Schön A, Hartmann RK*,RNase P of the Cyanophora paradoxa cyanelle: a plastid ribozyme,Biochimie, 2007, 89, 1528-38.