1955年8月,国家进行了全国性的第二次院系调整,调出药学系师生。1958年,党委决定由许殿英同志负责重新筹建药学系,并建立生药学、药物化学(包括药品鉴定)、药剂学3个教研室,其他化学课程由基础部化学教研室承担。1960年,学校恢复开办药学系,招收新生60名。朱恒璧教授任系主任,许殿英同志任系副主任。1960年4月,浙江省委决定,浙医学院改名为“浙江医科大学”,设置药学系。